MassIVE (Mass spectrometry Interactive Virtual Environment)
- Domaine(s) Spectrométrie
- Site https://massive.ucsd.edu/ProteoSAFe/static/massive.jsp
- Institution porteuse Centre de spectrométrie de masse computationnelle (Université de Californie à San Diego), financé par l'Institut National de la Santé (NIH).
- Lien avec les publications
Non obligatoire.
- Certification(s) Aucune
- Identifiant pérenne Non
- Licence(s)
Licence Creative Commons CC0 1.0 par défaut.
Le déposant peut aussi choisir une autre licence et la préciser dans une fichier « licence file ». - Possibilité d'embargo
Les jeux de données déposés sont privés par défaut. Ils n’apparaissent pas dans une recherche sur la base de données publique (il faut connaître l’URL précis pour y accéder), et sont protégés par un mot de passe.
Seul le propriétaire des données peut choisir s’il souhaite rendre les données publiques. - Standard des métadonnées
MassIVE rend obligatoire le renseignement de certains champs de métadonnées (plus d’information dans leur documentation et dans le chemin d’accès suivant : MassIVE > Submit Data to MassIVE > Dataset Submission Workflow)
- Versioning Non
- Type de données
Une soumission de données sur MassIVE doit comprendre au moins un fichier liste de pics (fichier de spectre de masse traité – formats mzXML, mzML ou MGF) ou un fichier de spectre brut (format non standard ou spécifique à l’instrumentation).
Plus de détails dans la documentation (chemin d’accès suivant : MassIVE > Submit Data to MassIVE > Dataset Submission Workflow > Submission File Categories) - Services associés
Les jeux de données sont vérifiés automatiquement lors du dépôt.
- Volume Non restreint
- Coût Gratuit
- Remarques
Il faut posséder un compte pour déposer des données.
- Contacts